种蛋消毒一般分二次进行第一次是在蛋产出后三十分钟内进行，第二次是在孵化前进行。
（1）福尔马林熏蒸消毒法；按每立方米（容积）30毫升福尔马林、15克高锰酸钾的量准备药物。将称量好的高锰酸钾预先放在一个瓷容器内，容器大小应为福尔马林用量的十倍以上，然后 按用量加入福尔马林，两种药物混合后即挥发出甲醛气体，密闭熏蒸20-30分钟。消毒完毕后，打开通风孔，让甲醛气体彻底消散。种蛋一旦入孵切忌用甲醛熏蒸消毒，自野外采集的种蛋也不要用甲醛熏蒸消毒。农家少量孔雀蛋消毒，可在书桌柜中进行。
（2）福尔马林浸泡消毒法：将福尔马林配成浓度为1.5%的溶液，种蛋在其中浸泡2-3分钟，取出沥干即可入孵。要注意溶液温度应保持在40摄氏度左右。
（3）高锰酸钾溶液浸泡消毒法：将高锰酸配成浓度为0.01%-0.05%的水溶液置于大盆内，将种蛋放入盆内浸泡2-3分钟，并洗去污物，取出晾干即可。
（4）碘溶液消毒法：将种蛋放在水温40摄氏度浓度为0.1%的碘溶液内，浸泡约一分钟，去污物，也可杀死蛋壳上的杂菌和白痢杆菌。经过多次浸泡种蛋的碘液，浓度逐渐降低，应增加新液或延长浸泡时间，以达到消毒的目的。
（5）新洁尔溶液浸泡消毒法：新洁尔为淡黄色胶状液体，易溶于水。用浓度为0.2%的新洁尔灭温水溶液浸泡种蛋1-2分钟，捞出沥干。也可将浓度为0.2%的新洁尔温水溶液装在喷雾器内直接喷洒在种蛋表面，经5-10分钟即达到消毒目的。使用新洁尔，切忌将肥皂、碘、高锰酸钾、升汞和碱等物质掺入，以免药液失效。
（6）过氧乙酸消毒法；过氧乙酸又称为醋酸，为强氧化剂，性质不稳定，高浓度溶液遇热易爆炸，浓度20%以下溶液则无此危险，故市售制品多为20%溶液。其稀释液只能保持药效3-7天，故应现用现配，过氧乙酸杀菌作用快而强，对细菌，病毒、霉菌和芽胞均有效。消毒时可用浓度为0.01%-0.04%的过氧乙酸溶液浸泡种蛋3-5分钟，取出晾干后入孵。
（7）土霉素消毒法：将0.5克盐酸土霉素溶解于一升的水中制成消毒液，浸泡种蛋15分钟。该方法对防治蓝孔雀白痢病和支原体病效果显著，但对病毒无效。
（8）二氧化氯液消毒法：将每千克温水兑入80-100毫克二氧化氯配成溶液，用喷雾器喷洒在种蛋表面即可。该方法不仅不破坏蛋壳的保护膜，且对减少蛋壳及蛋内的细菌数量效果较好。
（9）紫外线消毒法：安装40瓦红外线灯管，距地面约一米高，经照射10-15分钟后，即可达到消毒的目的。
江西抚州宜黄县宝丰特种生态珍禽养殖场